Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRT6CP48668 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms