Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGIRP43119 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms