Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PBX2P40425 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PBX2P40425 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PBX2P40425 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms