Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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