Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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