Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XPAP23025 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XPAP23025 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XPAP23025 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XPAP23025 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XPAP23025 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
XPAP23025 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XPAP23025 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XPAP23025 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XPAP23025 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XPAP23025 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XPAP23025 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XPAP23025 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XPAP23025 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XPAP23025 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XPAP23025 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XPAP23025 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms