Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT1P21579 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT1P21579 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT1P21579 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT1P21579 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT1P21579 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT1P21579 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT1P21579 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT1P21579 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT1P21579 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYT1P21579 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYT1P21579 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYT1P21579 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYT1P21579 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYT1P21579 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYT1P21579 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYT1P21579 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYT1P21579 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms