Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK11BP21127 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms