Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP4AP20648 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms