Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGB6P18564 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms