Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CPA3P15088 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPA3P15088 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPA3P15088 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms