Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GFAPP14136 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFAPP14136 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms