Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms