Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TPRP12270 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TPRP12270 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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