Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHGAP10645 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHGAP10645 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHGAP10645 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHGAP10645 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHGAP10645 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHGAP10645 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms