Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLI2P10070 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLI2P10070 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
GLI2P10070 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
GLI2P10070 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLI2P10070 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLI2P10070 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI2P10070 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI2P10070 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI2P10070 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI2P10070 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI2P10070 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI2P10070 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI2P10070 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GLI2P10070 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms