Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SERPIND1P05546 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SERPIND1P05546 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms