Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGB3P05106 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGB3P05106 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms