Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TGFB1P01137 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms