Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGFRP00533 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EGFRP00533 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGFRP00533 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGFRP00533 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGFRP00533 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGFRP00533 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGFRP00533 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGFRP00533 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGFRP00533 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms