Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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CLDN9O95484 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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CLDN9O95484 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CLDN9O95484 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN9O95484 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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