Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKAP2O75563 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms