Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COCHO43405 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COCHO43405 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COCHO43405 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COCHO43405 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COCHO43405 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COCHO43405 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COCHO43405 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COCHO43405 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COCHO43405 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COCHO43405 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COCHO43405 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COCHO43405 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms