Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA2O43364 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms