Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms