Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C9orf172C9J069 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf172C9J069 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf172C9J069 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf172C9J069 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf172C9J069 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf172C9J069 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf172C9J069 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf172C9J069 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf172C9J069 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C9orf172C9J069 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf172C9J069 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C9orf172C9J069 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms