Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDZK1P1A8MUH7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms