Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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