Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CD8B2A6NJW9 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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