Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRBC2A0A5B9 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms