Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9Y3F1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9Y3F1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.5 ms