Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EFR3BQ9Y2G0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms