Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms