Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX6Q9UNH7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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