Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNOT11Q9UKZ1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms