Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KDM5BQ9UGL1 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms