Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSFQ9UBX1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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