Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX3Q9UBR4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX3Q9UBR4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX3Q9UBR4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX3Q9UBR4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX3Q9UBR4 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX3Q9UBR4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX3Q9UBR4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX3Q9UBR4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX3Q9UBR4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX3Q9UBR4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX3Q9UBR4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX3Q9UBR4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX3Q9UBR4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX3Q9UBR4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LHX3Q9UBR4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX3Q9UBR4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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