Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DKK3Q9UBP4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DKK3Q9UBP4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms