Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
THUMPD1Q9NXG2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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