Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DDIT4Q9NX09 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms