Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LMBRD1Q9NUN5 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms