Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD34

LYRM4, LYR motif-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM4Q9HD34 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LYRM4Q9HD34 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LYRM4Q9HD34 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms