Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ACTRT3Q9BYD9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ACTRT3Q9BYD9 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms