Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC8Q9BY41 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms