Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BRIP1Q9BX63 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms