Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.4 ms