Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms