Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RBBP8Q99708 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP8Q99708 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms