Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDCA3Q99618 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDCA3Q99618 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms